Esta informação fica armazenada no .config do engenho não sendo necessário reconfigurar em uma atualização no mesmo ambiente. O configurador deve carregar a url já configurada ao ser acionado.
Caso isso não esteja acontecendo, abra uma SMS para avaliarmos.
Um cenário que irá requerer nova configuração é a adição de um novo servidor ao farm e então a instalação do workflow neste novo ambiente. A informação da url não está no banco de dados, mas sim em cada arquivo de configuração (por instalação), se facilitar e desejar é possível abrir uma SMS para mudar o comportamento e passar a gerenciar a informação no banco de dados.