Este problema acontece pq o Git vem do conceito do Linux e portanto diferencia nomes de branches com maiúsculas e minúsculas.
Mais para cima no log vão aparecer as duas branches, no caso deste exemplo veja abaixo:
Seen branch in repository origin/05.20.OSESP.00
Seen branch in repository origin/05.20.OSESP.MERGE
Seen branch in repository origin/05.20.OSESP.Merge
Seen branch in repository origin/05.20.medicarct2
Seen branch in repository origin/05.PRIME.02-SMS-1723635
A solução é remover (no servidor) uma das duas branches e fazer o fetch novamente.